Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms