Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB9F8W1W9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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NPIPB9F8W1W9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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NPIPB9F8W1W9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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NPIPB9F8W1W9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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NPIPB9F8W1W9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB9F8W1W9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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