Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TTC29Q8NA56 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms