Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX4

TRPC7, Short transient receptor potential channel 7, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC7Q9HCX4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRPC7Q9HCX4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRPC7Q9HCX4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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