Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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AP3B2Q13367 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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