Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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MTSS1O43312 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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