Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sp100O35892 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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