Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms