Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms