Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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