Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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STRN3Q13033 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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STRN3Q13033 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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STRN3Q13033 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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