Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK8P49336 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK8P49336 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK8P49336 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK8P49336 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms