Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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