Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPPQ6IPU0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms