Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms