Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDZD4Q76G19 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms