Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNFSF4P23510 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNFSF4P23510 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms