Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN1P18031 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms