Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLD1P28340 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLD1P28340 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLD1P28340 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLD1P28340 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms