Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Opn1mwO35599 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Opn1mwO35599 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms