Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rs1Q9Z1L4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rs1Q9Z1L4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rs1Q9Z1L4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rs1Q9Z1L4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms