Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmb2Q9R1P3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmb2Q9R1P3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms