Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf7Q9R1C0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf7Q9R1C0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms