Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nphs1Q9QZS7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms