Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms