Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn4Q9QXZ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn4Q9QXZ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms