Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psma6Q9QUM9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psma6Q9QUM9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms