Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms