Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A3Q9HAS3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC28A3Q9HAS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A3Q9HAS3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms