Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf23Q9ER63 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf23Q9ER63 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms