Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700018B08RikQ9DA83 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700018B08RikQ9DA83 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms