Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cmtm5Q9D6G9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmtm5Q9D6G9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtm5Q9D6G9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms