Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sppl3Q9CUS9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sppl3Q9CUS9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sppl3Q9CUS9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms