Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms