Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NOTCH4Q99466 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOTCH4Q99466 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms