Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

Predictions only

Length 5,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
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