Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD2Q96BF3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms