Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z69

Srgap1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap1Q91Z69 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Srgap1Q91Z69 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srgap1Q91Z69 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srgap1Q91Z69 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms