Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNL1Q8NG31 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNL1Q8NG31 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNL1Q8NG31 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms