Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim68Q8K243 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim68Q8K243 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim68Q8K243 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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