Protein–RNA interactions for Protein: Q810Y9

Pramel6, PRAMEl6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel6Q810Y9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pramel6Q810Y9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pramel6Q810Y9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel6Q810Y9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel6Q810Y9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel6Q810Y9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel6Q810Y9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramel6Q810Y9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel6Q810Y9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel6Q810Y9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramel6Q810Y9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms