Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC129Q6ZRS4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms