Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TmpoQ61033 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TmpoQ61033 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TmpoQ61033 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TmpoQ61033 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TmpoQ61033 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TmpoQ61033 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TmpoQ61033 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TmpoQ61033 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TmpoQ61033 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TmpoQ61033 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TmpoQ61033 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms