Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITRM1Q5JRX3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITRM1Q5JRX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITRM1Q5JRX3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms