Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SDK2Q58EX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDK2Q58EX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms