Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Chpf2Q3UU43 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chpf2Q3UU43 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms