Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TceancQ3US16 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TceancQ3US16 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TceancQ3US16 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms