Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx27Q3UHD6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms