Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RYR3Q15413 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms