Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAPTM4AQ15012 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAPTM4AQ15012 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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