Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col1a2Q01149 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col1a2Q01149 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col1a2Q01149 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col1a2Q01149 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms